主要区别是灭菌程度不同。

医用灭菌口罩是指口罩在出厂前经过了７天左右的消毒杀菌处理，这样的口罩安全性和卫生性都更高一些，而医用非灭菌口罩则没有经过这个消毒处理，在口罩上面可能残存细菌，防护级别不高。

医用口罩：是一种医疗防护用纺织品，多采用一层或者多层非织造布复合制作而成，主要生产工艺包括熔喷、纺粘、热风或者针刺等，具有抵抗液体、过滤颗粒物和细菌等效用。

分类：按性能特点及适用范围来分，医用口罩可分为医用防护口罩，医用外科口罩，普通医用口罩。